به دستور دبیر کل محترم مجمع تقریب، تبیین فقه سیاسی اسلام در قالب یک موسوعه به عنوان اولین محدوده کاری گروه حکومت اسلامی تعیین گردید که در دو مرحله انجام گیرد.
اول- تبیین نظر فقهاء شیعه
دوم- تبیین نظرفقهاء دیگر مذاهب اسلامی
مرحله اول با دو کار مقدماتی شروع شد:
۱. تهیه طرح
اعضاء گروه ابتداء طرحی برای کار تهیه کردند. بدین صورت که موضوعات مختلف فقه سیاسی در کتاب های مختلف فقهی اعم از شیعه و سنی رصد گردید و لیستی از واژگان فقه سیاسی در بیش از ۵۰۰ واژه تهیه گردید و در چند جلسه مشترک بین اعضای حکومت اسلامی و گروه فقه، مورد بحث قرار گرفت و در نهایت جهت سهولت در تقسیم کار، در ۵۲ عنوان کلی دسته‌بندی شد و در دستور کار اعضاء گروه قرار گرفت.
۲. تهیه شیوه نامه
اعضاء گروه شیوه نامه ای را تهیه کردند که بر اساس آن لازم است هر یک از محققین موضوع محوله را در کتب فقهی شیعه مطالعه نموده و نظر فقیه مورد نظر را از کتاب ها و منابع دست اول استخراج نموده و عین عبارت را نیز در پاورقی درج نماید.
بعد از تهیه طرح و شیوهنامه، هر یک از اعضاء مسئولیت تحقیق در یکی از موضوعات را به شرح زیر بر عهده گرفتند و تا خرداد سال ۱۳۹۵ همین موضوعات در دستور کار اعضاء گروه قرار داشت.
الف- مصطفی اسکندری
موضوع محول شده: حکومت اسلامی با ۱۳ زیر موضوع.
ب- سید احمد مرتضایی
موضوع محول شده «ولایت»با۳۸ زیر موضوع.
ج- ذبیح الله نعیمیان
موضوع تحقیق: «مصلحت در فقه سیاسی شیعه»با ۶ زیر موضوع.
موضوع در دست اقدام
از خرداد ماه سال ۱۳۹۵ که تحقیق در پدیده تکفیر در دستور کار پژوهشگاه قرار گرفت، گروه حکومت اسلامی نیز مانند سایر گروه ها موقتاً کار اصلی خود را تعطیل کرده و به پروژه تکفیر پیوسته است.
